More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_50709 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  100 
 
 
1055 aa  2165    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  39.13 
 
 
889 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  38.97 
 
 
893 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  38.49 
 
 
905 aa  598  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  36.4 
 
 
1003 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  39.47 
 
 
890 aa  581  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  38.55 
 
 
924 aa  579  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  38.08 
 
 
919 aa  575  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  40.02 
 
 
926 aa  571  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  36.69 
 
 
908 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  37.07 
 
 
908 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  36.79 
 
 
908 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  38.38 
 
 
924 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  35.28 
 
 
967 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  35.28 
 
 
967 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  46.43 
 
 
908 aa  483  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.4 
 
 
927 aa  479  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  46.58 
 
 
927 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  51.14 
 
 
924 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.84 
 
 
929 aa  357  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.39 
 
 
984 aa  357  8.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  38.87 
 
 
904 aa  355  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.82 
 
 
996 aa  353  7e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.05 
 
 
952 aa  351  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.76 
 
 
921 aa  350  8e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.42 
 
 
918 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.42 
 
 
918 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 
918 aa  348  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  39.18 
 
 
916 aa  348  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.91 
 
 
990 aa  347  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  40.76 
 
 
936 aa  347  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  42.28 
 
 
952 aa  346  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  37.29 
 
 
877 aa  345  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.08 
 
 
964 aa  345  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  40.58 
 
 
935 aa  345  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.5 
 
 
922 aa  343  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  38.91 
 
 
909 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  40.11 
 
 
906 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.22 
 
 
951 aa  340  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.79 
 
 
933 aa  340  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  39.77 
 
 
906 aa  340  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.01 
 
 
981 aa  340  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  39.68 
 
 
863 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  37.76 
 
 
953 aa  339  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 
919 aa  337  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.01 
 
 
950 aa  337  7.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.05 
 
 
950 aa  337  9e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  38.89 
 
 
972 aa  336  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  39.14 
 
 
918 aa  335  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.54 
 
 
951 aa  335  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.93 
 
 
931 aa  333  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  37.21 
 
 
994 aa  329  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.81 
 
 
932 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  40.19 
 
 
940 aa  324  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.72 
 
 
917 aa  319  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.73 
 
 
815 aa  315  3.9999999999999997e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  28.51 
 
 
1068 aa  307  7e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  36.26 
 
 
872 aa  296  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 
1068 aa  295  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  35.85 
 
 
1073 aa  288  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  34.5 
 
 
933 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.21 
 
 
762 aa  284  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  33.09 
 
 
998 aa  283  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.5 
 
 
709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
843 aa  273  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  54.69 
 
 
961 aa  211  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 
835 aa  208  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.08 
 
 
837 aa  207  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.3 
 
 
947 aa  207  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  48.83 
 
 
1026 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.8 
 
 
847 aa  202  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.93 
 
 
837 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.28 
 
 
832 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.5 
 
 
868 aa  198  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.21 
 
 
832 aa  194  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
851 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.49 
 
 
847 aa  191  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.01 
 
 
852 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.01 
 
 
852 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.01 
 
 
852 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 
1231 aa  187  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  29.36 
 
 
885 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.44 
 
 
424 aa  177  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.74 
 
 
870 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  47.62 
 
 
1023 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  43.75 
 
 
1209 aa  174  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  46.43 
 
 
1185 aa  173  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  47.45 
 
 
1293 aa  171  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  29.28 
 
 
842 aa  171  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.75 
 
 
791 aa  170  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  46.43 
 
 
1239 aa  167  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  39.56 
 
 
1175 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.24 
 
 
799 aa  163  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  29.57 
 
 
860 aa  162  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  30.24 
 
 
824 aa  162  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.92 
 
 
700 aa  159  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.57 
 
 
715 aa  157  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.63 
 
 
800 aa  154  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.08 
 
 
807 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.81 
 
 
723 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>