133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29641 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009367  OSTLU_47417  predicted protein  100 
 
 		 397 aa  820    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29641  predicted protein  100 
 
 		 409 aa  845    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14762  isocitrate dehydrogenase  64.99 
 
 		 357 aa  497  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.25 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2528  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  32.6 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000000300783  normal  0.0692405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13371  isocitrate dehydrogenase  33.01 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7976  isocitrate dehydrogenase  33.57 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0685  isocitrate dehydrogenase  31.86 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2568  isocitrate dehydrogenase  31.45 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0398  isocitrate dehydrogenase  33.42 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.287914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1222  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  31.45 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593452  normal  0.0592242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  32.68 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3960  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.37 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1254  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  32.84 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1281  isocitrate dehydrogenase  32.52 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000588967  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0388  isocitrate dehydrogenase  32.6 
 
 		 407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1011  isocitrate dehydrogenase  32.23 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3007  isocitrate dehydrogenase  32.12 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.375346  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0911  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  32.35 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1161  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1133  isocitrate dehydrogenase  32.44 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05050  isocitrate dehydrogenase  30.22 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1199  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6478  isocitrate dehydrogenase  31.45 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4210  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.63 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  31.36 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3988  isocitrate dehydrogenase  31.13 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2164  isocitrate dehydrogenase  32.93 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0263756  normal  0.0589058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1459  isocitrate dehydrogenase  30.81 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.362836  normal  0.369512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2367  isocitrate dehydrogenase  32.21 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3039  isocitrate dehydrogenase  32.21 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4173  isocitrate dehydrogenase  31.2 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3793  isocitrate dehydrogenase  31.2 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0923125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5427  isocitrate dehydrogenase  30.96 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444249  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0743  isocitrate dehydrogenase  31.78 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.262028  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  30.79 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2545  isocitrate dehydrogenase  32.2 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4413  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.77 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1519  isocitrate dehydrogenase  33.17 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.997525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1523  isocitrate dehydrogenase  30.58 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.030562  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1953  isocitrate dehydrogenase  31.95 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123809  normal  0.403096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  32.13 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1576  isocitrate dehydrogenase  32.2 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06080  isocitrate dehydrogenase  29.78 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.54235 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04090  isocitrate dehydrogenase (NADP+), putative  31.64 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00968554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3254  isocitrate dehydrogenase  30.75 
 
 		 402 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1913  isocitrate dehydrogenase  31.39 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2099  isocitrate dehydrogenase  31.89 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.369839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3527  isocitrate dehydrogenase  32.52 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43028  normal  0.961267 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02999  Mitochondrial NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (EC 1.1.1.42) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN7]  31.93 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.626077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1559  isocitrate dehydrogenase  31.89 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0210  isocitrate dehydrogenase  32.13 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0446  isocitrate dehydrogenase  31.89 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1737  isocitrate dehydrogenase  32.12 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4569  isocitrate dehydrogenase  31.22 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119875  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1294  isocitrate dehydrogenase  31.13 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3732  isocitrate dehydrogenase  31.46 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4362  isocitrate dehydrogenase  31.87 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6592  isocitrate dehydrogenase  30.81 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.685911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2576  isocitrate dehydrogenase  30.94 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.050087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2580  isocitrate dehydrogenase  32.04 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0101084  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2631  isocitrate dehydrogenase  31.7 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4814  isocitrate dehydrogenase  31.45 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0820117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3463  isocitrate dehydrogenase  34.31 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1992  isocitrate dehydrogenase  32.2 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1623  isocitrate dehydrogenase  31.33 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1117  isocitrate dehydrogenase  30.64 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0356  isocitrate dehydrogenase  31.58 
 
 		 405 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3141  isocitrate dehydrogenase  34.06 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120498  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1964  isocitrate dehydrogenase  31.4 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.431704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1267  isocitrate dehydrogenase  30.32 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1228  isocitrate dehydrogenase  31.57 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  31.57 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5765  isocitrate dehydrogenase  32.36 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3730  isocitrate dehydrogenase  30.51 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377053  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2372  isocitrate dehydrogenase  31.2 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3338  isocitrate dehydrogenase  34.06 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4767  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.7 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2961  isocitrate dehydrogenase  31.7 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0688602  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43870  Isocitrate dehydrogenase [NADP] peroxisomal (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (PS-NADP-IDH) (CtIDP2)  30.77 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2878  isocitrate dehydrogenase  28.29 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.367797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  29.81 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0565  isocitrate dehydrogenase  29.41 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1668  isocitrate dehydrogenase  29.09 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0457  isocitrate dehydrogenase  30.68 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0527606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  28.68 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  27.62 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  29.02 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  24.6 
 
 		 362 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  24.21 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  25.61 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6646  3-isopropylmalate dehydrogenase  25.97 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  24.5 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7390  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.27 
 
 		 368 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20934  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.99 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3762  3-isopropylmalate dehydrogenase  26.71 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3381  3-isopropylmalate dehydrogenase  25.14 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3428  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.43 
 
 		 352 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0240  3-isopropylmalate dehydrogenase  23.67 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198337  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0859  3-isopropylmalate dehydrogenase  26.09 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>