More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0554 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  100 
 
 
372 aa  769    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 
372 aa  530  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  59.84 
 
 
365 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  54.37 
 
 
367 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  59.46 
 
 
332 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  53.83 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  53.28 
 
 
380 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.28 
 
 
380 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 
371 aa  401  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  52.07 
 
 
383 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  52.46 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  53.14 
 
 
373 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  59.41 
 
 
337 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.82 
 
 
369 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  55.49 
 
 
327 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  55.35 
 
 
326 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  55.35 
 
 
326 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  55.05 
 
 
326 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50 
 
 
366 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 
326 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  53.61 
 
 
332 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  54.24 
 
 
332 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  53.5 
 
 
331 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  53.39 
 
 
357 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 
366 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50.72 
 
 
372 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  47.55 
 
 
367 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 
375 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 
369 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  46.78 
 
 
368 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  46.69 
 
 
364 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.23 
 
 
330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 
329 aa  353  4e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 
330 aa  346  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.58 
 
 
377 aa  346  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 
367 aa  345  6e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  46.46 
 
 
372 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 
367 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  47.92 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 
356 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  45.38 
 
 
376 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.18 
 
 
362 aa  339  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 
357 aa  339  5e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 
371 aa  338  9e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45.38 
 
 
376 aa  337  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.54 
 
 
365 aa  335  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  47.27 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  47.18 
 
 
375 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  47.15 
 
 
371 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45 
 
 
371 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 
365 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.72 
 
 
365 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 
365 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 
365 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  45.73 
 
 
375 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  45.73 
 
 
365 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 
361 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 
379 aa  332  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.45 
 
 
365 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.74 
 
 
365 aa  331  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 
326 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  45.9 
 
 
365 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  46.72 
 
 
365 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 
369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  47.49 
 
 
361 aa  328  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 
364 aa  328  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 
367 aa  328  9e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  51.78 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  45.9 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.91 
 
 
372 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  48.98 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  48.69 
 
 
349 aa  325  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  44.99 
 
 
375 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  51.38 
 
 
331 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 
374 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 
360 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 
362 aa  323  3e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  45.81 
 
 
364 aa  323  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  44.69 
 
 
375 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  47.04 
 
 
358 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  45.05 
 
 
375 aa  322  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.2 
 
 
371 aa  322  8e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  45.38 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  43.8 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  43.37 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 
374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  44.11 
 
 
365 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
356 aa  319  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  44.38 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.32 
 
 
325 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  47.32 
 
 
343 aa  318  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 
356 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  45.77 
 
 
356 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 
367 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>