69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1499 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  47.21 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  42.48 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  65.38 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  58.95 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  38.68 
 
 		 119 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  30.4 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  35.54 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  31.5 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  27.61 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  34.96 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  36.13 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  30.51 
 
 		 123 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  32.23 
 
 		 147 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  35.78 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  35 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  34 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  35 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  31.45 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  31.3 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  29.63 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  32 
 
 		 111 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  28.12 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  27.83 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  31.96 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.05 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.41 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  28.7 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  27.42 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  31.48 
 
 		 146 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  31.48 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  29.66 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  27.2 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  26.79 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  27.42 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  27.34 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  26.02 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.07 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  29.73 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  28.81 
 
 		 179 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  26.05 
 
 		 169 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  27.97 
 
 		 170 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  27.97 
 
 		 170 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  25.21 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.83 
 
 		 136 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  31 
 
 		 137 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  28.7 
 
 		 112 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  28.85 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  26.79 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  33.65 
 
 		 113 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  31.9 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  25 
 
 		 167 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  26.92 
 
 		 129 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  31.65 
 
 		 112 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  29.66 
 
 		 112 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  28.57 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  32.35 
 
 		 112 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  41.38 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  30.85 
 
 		 111 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  31.65 
 
 		 168 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>