More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3863 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.64 
 
 
251 aa  362  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  69.33 
 
 
258 aa  341  5.999999999999999e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.8 
 
 
250 aa  340  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.94 
 
 
251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.93 
 
 
247 aa  325  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60 
 
 
250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.96 
 
 
252 aa  297  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
255 aa  285  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.4 
 
 
251 aa  280  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
286 aa  234  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.38 
 
 
256 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
264 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
261 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
255 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 
258 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
272 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 
254 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.17 
 
 
260 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
257 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
254 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
254 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
255 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 
254 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 
254 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
255 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 
260 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  40 
 
 
254 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  40 
 
 
254 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  40 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  40 
 
 
254 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
254 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  40 
 
 
254 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
254 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
257 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  42.63 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
257 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
255 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  44.53 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
266 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
257 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
248 aa  158  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
269 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
250 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
266 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
253 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.06 
 
 
247 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
255 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.34 
 
 
246 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
246 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
254 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
258 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.25 
 
 
248 aa  155  7e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
253 aa  154  9e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
256 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
266 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
254 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
256 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.85 
 
 
248 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
249 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.43 
 
 
247 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
256 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 
248 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
246 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  43.43 
 
 
248 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
260 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.86 
 
 
247 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
248 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
268 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
245 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
247 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
255 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
261 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.98 
 
 
247 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
249 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08226  putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.74 
 
 
269 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 
246 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.89 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  37.11 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>