More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2660 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  72.46 
 
 		 143 aa  214  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 182 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.83 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  66.9 
 
 		 147 aa  199  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  73.48 
 
 		 136 aa  197  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  64.08 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  65.54 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  65.28 
 
 		 158 aa  189  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  63.19 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  64.58 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  64.79 
 
 		 165 aa  186  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 168 aa  183  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  57.82 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  48.92 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.45 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  43.06 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.75 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 186 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 170 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 179 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 162 aa  90.1  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  36.8 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 174 aa  87  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  38.35 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.62 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.14 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  38.28 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  84.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 175 aa  84.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 		 155 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 174 aa  84.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>