65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0537 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  100 
 
 
333 aa  670    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  37.15 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  38.36 
 
 
307 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  50 
 
 
294 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  31.23 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  37.14 
 
 
291 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  32.59 
 
 
297 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  32.28 
 
 
319 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  32.7 
 
 
297 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  31.8 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  33 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  32.02 
 
 
298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  32.08 
 
 
300 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  30.84 
 
 
286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  54.21 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  42.25 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  41.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  30.84 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  40.7 
 
 
300 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  53.1 
 
 
299 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  41.28 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  42.67 
 
 
301 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  44.67 
 
 
297 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  42.67 
 
 
301 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  40.48 
 
 
300 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  43.88 
 
 
310 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  43.86 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  31.13 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  41.59 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  28.88 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  36.8 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  28.88 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  26.71 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  29.58 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  29.11 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  28.21 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  41.58 
 
 
654 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  27.36 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  32.2 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  26.75 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  25.24 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  33.05 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  25.49 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  30.51 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  33.61 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  32.43 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  33.01 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  33.01 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  25.8 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  31.37 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  31.37 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  26.52 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  39.68 
 
 
292 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  41.94 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  36.92 
 
 
244 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  44 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  45.1 
 
 
235 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  35.29 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  38.71 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  40.82 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  32.26 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  29.47 
 
 
289 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  29.25 
 
 
246 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.33 
 
 
250 aa  43.1  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>