More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0370 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  818    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  53.37 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  52.09 
 
 
413 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  38.85 
 
 
403 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  36.69 
 
 
441 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  38.4 
 
 
404 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  36.18 
 
 
404 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
436 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  30.73 
 
 
422 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.98 
 
 
422 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  32.85 
 
 
419 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  29.7 
 
 
429 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  30.84 
 
 
416 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  29.1 
 
 
406 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.97 
 
 
405 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.2 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 
412 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  33.03 
 
 
387 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  33.03 
 
 
405 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.64 
 
 
419 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  31.82 
 
 
405 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  31.91 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  28.29 
 
 
407 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
535 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
830 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.47 
 
 
415 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
475 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  24.47 
 
 
415 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 
411 aa  101  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  26.13 
 
 
428 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 
475 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  26.11 
 
 
465 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 
475 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 
475 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 
475 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 
475 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.41 
 
 
419 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  28.27 
 
 
716 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  25.14 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  25.8 
 
 
411 aa  98.2  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  24.71 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.67 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.58 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  23.68 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  24.83 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.12 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.84 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.19 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.71 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  29.6 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.68 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.48 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  33.33 
 
 
475 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  30.68 
 
 
715 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.85 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  36.24 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  23.74 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  23.36 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  30.99 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.83 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  24.47 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.83 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  24.52 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.38 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.59 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.38 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.43 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  34.08 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  33.88 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  33.97 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.38 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.38 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.38 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.41 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.38 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.38 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.25 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.43 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  27.54 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  22.79 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.24 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.62 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  30.49 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.54 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.46 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  26.01 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.32 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>