139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2518 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  100 
 
 		 225 aa  432  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  60.19 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  42.72 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  46.81 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0158  Rhomboid family protein  46.81 
 
 		 186 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1636  Rhomboid family protein  32.33 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  34.31 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  36 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 326 aa  65.1  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  31.79 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  35.75 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  34.85 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  38.12 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  35.54 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  34.42 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.51 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.93 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  32.32 
 
 		 360 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  32.54 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  26.84 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  32.93 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  32.35 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  29.56 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  31.47 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.41 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  40.45 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  36.42 
 
 		 360 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  36.42 
 
 		 360 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.68 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  33.55 
 
 		 362 aa  52  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  29.05 
 
 		 342 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  33.91 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  33.04 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  33.1 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  29.73 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  31.58 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  25.59 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  27.74 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  30.46 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  31.06 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  28.21 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  28.67 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  37.21 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  35.16 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  26.45 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13571  hypothetical protein  26.34 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  28.72 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  27.56 
 
 		 176 aa  48.5  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13471  hypothetical protein  25.56 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  30 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  30.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  32.69 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  38.82 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  32.93 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  30.26 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  25.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  25.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  27.65 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  27.23 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  26.35 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  28.28 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  41.11 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  28.28 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  26.75 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  28.28 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  28.28 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  41.67 
 
 		 492 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  27.72 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  30 
 
 		 289 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  37.65 
 
 		 283 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  27.74 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  27.59 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  32.73 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  28.21 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  34.04 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  38.64 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  28.28 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.46 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  27.97 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.33 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>