89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1831 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  92.13 
 
 		 343 aa  652    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 343 aa  699    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  79.59 
 
 		 343 aa  570  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  74.71 
 
 		 349 aa  529  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  73.7 
 
 		 348 aa  517  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  60.29 
 
 		 325 aa  428  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  60.88 
 
 		 325 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  56.8 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  62.2 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  56.18 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  56.68 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  57.14 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  53.51 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  55.26 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  44.74 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  45.16 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  45.16 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  45.16 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  43.84 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  44.87 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  43.06 
 
 		 322 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  44 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  43.7 
 
 		 358 aa  277  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  43.59 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  43.43 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  44.67 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  42.74 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  42.27 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  34.21 
 
 		 348 aa  206  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  35.84 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  36.23 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  35.07 
 
 		 658 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  38.35 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  33.43 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  34.29 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  32.64 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.01 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  33.46 
 
 		 250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  26.98 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  28.41 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  27.94 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  28.57 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  29.06 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  27.63 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.6 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  28.35 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  25.74 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  26.15 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  28.88 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  28.37 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  25.95 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  24.37 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  24.51 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  27.08 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  25.76 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  24.89 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  26.64 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  26.97 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  23.93 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  25.11 
 
 		 216 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  23.26 
 
 		 456 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  26.76 
 
 		 598 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  26.73 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  24.24 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  25.22 
 
 		 541 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  23.48 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  44.44 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  34.92 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  25.37 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  25.99 
 
 		 365 aa  46.2  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  22.67 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10322  Rad51 family DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14460)  26.72 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.177234 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  27.32 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1567  hypothetical protein  45.95 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  25.33 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  30.53 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  22.22 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  24.26 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  23.75 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  24.89 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  50 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  28.03 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  23.18 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  32.22 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  32.35 
 
 		 481 aa  43.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  23.61 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  24.89 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>