More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3916 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 510 aa  1056    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  58.27 
 
 		 506 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 526 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 508 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  31.13 
 
 		 508 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  31.71 
 
 		 508 aa  257  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.13 
 
 		 508 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.13 
 
 		 508 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  31.32 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.8 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.8 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  31.52 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.95 
 
 		 508 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 521 aa  250  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.07 
 
 		 479 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 524 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  33.2 
 
 		 504 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 507 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 513 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 508 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 513 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 508 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  31.56 
 
 		 507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  30.43 
 
 		 521 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  29.88 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  29.88 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 499 aa  199  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 592 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 482 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.86 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 516 aa  192  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.72 
 
 		 227 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 507 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 503 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  28.61 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 513 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 502 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  29.49 
 
 		 289 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 420 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 432 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 435 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  25.31 
 
 		 427 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 401 aa  87.4  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 434 aa  87  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  28.27 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  28.54 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  28.54 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  28.29 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  27.63 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  25.61 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  27.36 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  25.83 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  27.11 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>