54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5326 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 236 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  54.92 
 
 		 246 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  46.84 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  50.72 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  44.53 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  50.38 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  46.15 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  47.37 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  50.38 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  43.97 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  39.07 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  38.24 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  38.61 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  41.27 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  39.07 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  37.28 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  38.3 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  33.33 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  34.8 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  43.08 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  35.61 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  41.67 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  25.76 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  28.29 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  27.1 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  36.49 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  33.78 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 300 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 338 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 426 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  40.71 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  33.8 
 
 		 339 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  27.93 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  37.59 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  47.54 
 
 		 519 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  45.57 
 
 		 361 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  23.38 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  25 
 
 		 333 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>