195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4847 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 431 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  66.2 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  46.7 
 
 		 432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  45.67 
 
 		 441 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  36.89 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  40.93 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 		 491 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  39.68 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  36.56 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 434 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  37.47 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  38.35 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  38.35 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  38.35 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  24.69 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.44 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  22.17 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  20.71 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.65 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.65 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 529 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.54 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  20.65 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  20.49 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  23.84 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  20.38 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  24.06 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25.26 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  19.58 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.21 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 543 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.69 
 
 		 1833 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  20.53 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.74 
 
 		 1876 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.29 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 710 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  22.37 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  24.15 
 
 		 730 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  20.38 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.2 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  23.77 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  26.56 
 
 		 505 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  25.69 
 
 		 688 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  25.49 
 
 		 709 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>