More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1486 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1486  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
586 aa  1182    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178945  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2307  AAA ATPase central domain protein  80.27 
 
 
587 aa  945    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000305444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2153  AAA ATPase central domain protein  70.22 
 
 
573 aa  779    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1916  AAA ATPase central domain protein  62.94 
 
 
583 aa  725    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000404322 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0907  AAA ATPase central domain protein  62.23 
 
 
579 aa  696    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.205473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2241  ATPase central domain-containing protein  74.03 
 
 
593 aa  855    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451188  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12147  ATPase  66.05 
 
 
609 aa  784    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1201  AAA ATPase central domain protein  62.76 
 
 
550 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.226586  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3144  vesicle-fusing ATPase  66.89 
 
 
615 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1809  vesicle-fusing ATPase  88.91 
 
 
584 aa  1020    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4472  AAA ATPase central domain-containing protein  74.2 
 
 
596 aa  866    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22080  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  71.93 
 
 
602 aa  843    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2423  AAA ATPase central domain protein  77.16 
 
 
594 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407785  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2458  AAA ATPase central domain protein  69.65 
 
 
607 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.839877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5891  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit- like protein  82.43 
 
 
587 aa  950    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0900472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2678  AAA ATPase central domain protein  75.73 
 
 
593 aa  868    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2242  AAA ATPase central domain protein  64.98 
 
 
560 aa  701    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2004  AAA ATPase central domain protein  70.39 
 
 
544 aa  749    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2358  ATPase central domain-containing protein  74.2 
 
 
593 aa  861    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2630  vesicle-fusing ATPase  75.6 
 
 
602 aa  889    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.609425  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20900  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  67.57 
 
 
581 aa  741    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1485  AAA ATPase central domain protein  68.42 
 
 
543 aa  721    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2975  AAA ATPase central domain protein  68.72 
 
 
592 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  0.0176892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3132  vesicle-fusing ATPase  66.89 
 
 
615 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2173  vesicle-fusing ATPase  63.37 
 
 
594 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0532603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1838  AAA ATPase central domain-containing protein  81.74 
 
 
587 aa  952    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3069  vesicle-fusing ATPase  66.33 
 
 
615 aa  790    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291044  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1184  vesicle-fusing ATPase  78.16 
 
 
583 aa  907    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.89835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2639  vesicle-fusing ATPase  77.49 
 
 
584 aa  887    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3194  vesicle-fusing ATPase  66.89 
 
 
615 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176841  normal  0.0401396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3458  vesicle-fusing ATPase  65.83 
 
 
615 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2231  AAA ATPase central domain protein  71.58 
 
 
599 aa  837    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1866  AAA ATPase central domain protein  72.48 
 
 
578 aa  787    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4882  ATPase central domain-containing protein  76.42 
 
 
601 aa  906    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000159946  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16200  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  50.4 
 
 
533 aa  505  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11860  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  45.97 
 
 
584 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0428496  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1971  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  44.38 
 
 
521 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.89 
 
 
763 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.14 
 
 
721 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.11 
 
 
719 aa  195  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  40.27 
 
 
810 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.96 
 
 
718 aa  194  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.92 
 
 
808 aa  194  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.49 
 
 
757 aa  193  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.73 
 
 
754 aa  193  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.26 
 
 
701 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.47 
 
 
754 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.03 
 
 
754 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.95 
 
 
754 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  42.34 
 
 
732 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  45.91 
 
 
754 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.7 
 
 
760 aa  189  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.54 
 
 
759 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.66 
 
 
735 aa  188  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.58 
 
 
727 aa  187  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  46.57 
 
 
713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.31 
 
 
731 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.55 
 
 
806 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45 
 
 
731 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.91 
 
 
740 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.7 
 
 
784 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.8 
 
 
800 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.39 
 
 
781 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.98 
 
 
736 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.44 
 
 
805 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.8 
 
 
781 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  39.52 
 
 
826 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.09 
 
 
723 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.66 
 
 
852 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  38.05 
 
 
389 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  43.11 
 
 
749 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.44 
 
 
740 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.98 
 
 
743 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.24 
 
 
742 aa  181  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  39.15 
 
 
393 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.94 
 
 
769 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  42.02 
 
 
739 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.3 
 
 
732 aa  179  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.32 
 
 
731 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  42.44 
 
 
746 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  38.26 
 
 
414 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  44.5 
 
 
722 aa  179  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.41 
 
 
737 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.44 
 
 
731 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 
736 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.06 
 
 
742 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  37.78 
 
 
407 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45 
 
 
737 aa  177  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.89 
 
 
739 aa  177  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  37.46 
 
 
407 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  39.6 
 
 
407 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  34.87 
 
 
379 aa  176  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.92 
 
 
709 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  36.97 
 
 
407 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.76 
 
 
768 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.76 
 
 
805 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.09 
 
 
738 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.02 
 
 
753 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  37.46 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  45.41 
 
 
764 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>