189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1000 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  41.75 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3872  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.600353  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_003296  RS00705  putative transcription regulator protein  42.39 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0312291  normal  0.40859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0364  GntR domain-containing protein  36.33 
 
 		 272 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3072  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 290 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6879  GntR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0423677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6189  transcriptional regulator, GntR family  40.07 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4554  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04697  putative transcription regulator protein  41.3 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 292 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  26.72 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 226 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  25.41 
 
 		 218 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  34.48 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 231 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 216 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4963  transcriptional regulator, GntR family  48.08 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.16936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  48.89 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  43.14 
 
 		 277 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  49.06 
 
 		 237 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  45.65 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4903  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  50.98 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  43.86 
 
 		 250 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  47.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 261 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 222 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 267 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 300 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  46 
 
 		 249 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  41.07 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0403  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  38.24 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  40 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  37.93 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2403  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>