More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3879 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 508 aa  1018    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.44 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.53 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.47 
 
 		 429 aa  286  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.07 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.07 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.25 
 
 		 416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  42.56 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.58 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  39.49 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.84 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  39.26 
 
 		 416 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.2 
 
 		 419 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.4 
 
 		 410 aa  230  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.42 
 
 		 411 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.82 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  38.4 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  39.18 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.19 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.4 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.27 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.73 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.58 
 
 		 409 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.77 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.22 
 
 		 416 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  37.11 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.25 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1016  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  41.63 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.38 
 
 		 430 aa  194  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.94 
 
 		 397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.42 
 
 		 392 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.42 
 
 		 413 aa  183  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.04 
 
 		 404 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.46 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.28 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  35.79 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.76 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  30.84 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.75 
 
 		 408 aa  173  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  30.96 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  35.73 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 		 399 aa  169  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17190  diaminopimelate decarboxylase  30.12 
 
 		 395 aa  168  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  30.73 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.63 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  31.98 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  31.57 
 
 		 415 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  29.83 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  29.34 
 
 		 402 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.61 
 
 		 400 aa  160  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.61 
 
 		 400 aa  160  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  31.96 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  29.31 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  31.25 
 
 		 420 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  29.31 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  30.77 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  32.77 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  30.95 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  30.37 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  30.35 
 
 		 425 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.95 
 
 		 421 aa  156  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  31.19 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  31.82 
 
 		 414 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  32.37 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  32.28 
 
 		 423 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  27.08 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  31.03 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  28.09 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  31.64 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  30.79 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  27.32 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  31.03 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4702  diaminopimelate decarboxylase  29.17 
 
 		 458 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  30.91 
 
 		 418 aa  154  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  31 
 
 		 414 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  30.09 
 
 		 414 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  27.76 
 
 		 406 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 		 419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  28.22 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5579  diaminopimelate decarboxylase  32.27 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  31.16 
 
 		 415 aa  153  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  31.16 
 
 		 461 aa  153  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  29.8 
 
 		 425 aa  153  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  29.25 
 
 		 429 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>