More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2296 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  100 
 
 		 625 aa  1224    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  51.05 
 
 		 388 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  52.31 
 
 		 505 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  48.48 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 498 aa  130  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  42.77 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  45 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 374 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.18 
 
 		 337 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  44.35 
 
 		 475 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 475 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 475 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  40.88 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 394 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 502 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  41.35 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  40 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  37.41 
 
 		 417 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.93 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 491 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  36.02 
 
 		 472 aa  100  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 479 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 398 aa  98.2  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 452 aa  97.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 432 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  50.53 
 
 		 327 aa  96.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  40.15 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 340 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 463 aa  94.7  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 345 aa  94.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  37.41 
 
 		 374 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  35.97 
 
 		 388 aa  90.9  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 337 aa  90.9  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 453 aa  90.1  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  41.05 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 308 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  42.97 
 
 		 225 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 337 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 231 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 256 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 256 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.16 
 
 		 337 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.86 
 
 		 321 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 150 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  46.94 
 
 		 315 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.9 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  39.26 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.23 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.97 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  35.21 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  35.15 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  36.64 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 257 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  32.5 
 
 		 273 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  35.15 
 
 		 208 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 257 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 257 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 256 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  34.33 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 248 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  34.91 
 
 		 208 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  36.43 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.31 
 
 		 150 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.33 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  38.57 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.95 
 
 		 1048 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  34.56 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  36.24 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  37.69 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.42 
 
 		 235 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  35.56 
 
 		 204 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.01 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.96 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  36.36 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  36.96 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  30.73 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>