More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0408 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0408  ribosomal protein S1  100 
 
 		 553 aa  1120    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0617  30S ribosomal protein S1  43.93 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0402  30S ribosomal protein S1  41.87 
 
 		 567 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1090  30S ribosomal protein S1  40.71 
 
 		 550 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  37.98 
 
 		 556 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  38.18 
 
 		 557 aa  350  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  38.59 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  39.19 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  39.6 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  38.79 
 
 		 557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  35.87 
 
 		 556 aa  340  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  37.68 
 
 		 555 aa  340  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  39.39 
 
 		 555 aa  340  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  36.11 
 
 		 555 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  36.31 
 
 		 573 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  37.78 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  35.57 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  37.52 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  37.95 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  38.79 
 
 		 559 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  36.69 
 
 		 575 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  38.79 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  38.79 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2339  30S ribosomal protein S1  38.18 
 
 		 569 aa  336  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00489204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  38.79 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  38.79 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  37.58 
 
 		 561 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  37.58 
 
 		 561 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  36.19 
 
 		 568 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  36.19 
 
 		 568 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  38.33 
 
 		 559 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  38.59 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  38.59 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  38.59 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  37.58 
 
 		 561 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2237  30S ribosomal protein S1  38.38 
 
 		 557 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000585516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  36.4 
 
 		 557 aa  334  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2073  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 		 555 aa  334  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000721785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  35.83 
 
 		 560 aa  333  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 558 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  35.76 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 589 aa  333  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  38.38 
 
 		 555 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  38.38 
 
 		 555 aa  332  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1735  30S ribosomal protein S1  38.38 
 
 		 557 aa  332  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  37.58 
 
 		 558 aa  332  8e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  35.43 
 
 		 571 aa  332  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  37.17 
 
 		 558 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  37.17 
 
 		 558 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  37.17 
 
 		 558 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 571 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  37.17 
 
 		 558 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2003  30S ribosomal protein S1  38.38 
 
 		 565 aa  332  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0183924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  35.1 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  36.25 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  37.37 
 
 		 561 aa  331  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 576 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 576 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 570 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 576 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 576 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  37.5 
 
 		 570 aa  330  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  37.64 
 
 		 556 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  34.65 
 
 		 567 aa  329  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  36.38 
 
 		 558 aa  329  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  36.77 
 
 		 559 aa  329  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  38.46 
 
 		 553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  37.97 
 
 		 558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  36.86 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  36.62 
 
 		 559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  36.23 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  38.38 
 
 		 563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>