260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_20731 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  97.61 
 
 
251 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  53.28 
 
 
247 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  57.01 
 
 
247 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  55.81 
 
 
248 aa  245  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  54.72 
 
 
248 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  49.3 
 
 
250 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  44.72 
 
 
249 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  44.83 
 
 
249 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  41.94 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  37.79 
 
 
249 aa  158  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
251 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 
257 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  36.64 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 
273 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  32.78 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.77 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  39.72 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  35.46 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  28.91 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  34.27 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.92 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.97 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  32.88 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 
276 aa  72  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.45 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  26.16 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.12 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
288 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  33.14 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  26.73 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.67 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  27.22 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  29.01 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.86 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.18 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
325 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.72 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>