More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5895 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  100 
 
 
496 aa  994    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  64.47 
 
 
471 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  63.86 
 
 
531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  62.13 
 
 
528 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  62.13 
 
 
528 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  43.68 
 
 
390 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  41.67 
 
 
793 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  37.86 
 
 
452 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  37.86 
 
 
428 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  32.56 
 
 
391 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  31.85 
 
 
483 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.89 
 
 
784 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  33.99 
 
 
459 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  35.44 
 
 
790 aa  177  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  32.97 
 
 
796 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  31.38 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  32.97 
 
 
796 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  31.6 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  33.75 
 
 
785 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  30.4 
 
 
408 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.97 
 
 
966 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  30.94 
 
 
395 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  31.22 
 
 
574 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.99 
 
 
582 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  33.5 
 
 
792 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  28.74 
 
 
392 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.48 
 
 
381 aa  163  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  31.86 
 
 
416 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.95 
 
 
395 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  30.31 
 
 
379 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  28.34 
 
 
430 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  29.02 
 
 
360 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  32.44 
 
 
717 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.09 
 
 
379 aa  149  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  32.67 
 
 
591 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.67 
 
 
379 aa  148  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.22 
 
 
385 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  31.13 
 
 
361 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  31.26 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  30.2 
 
 
566 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  30.95 
 
 
351 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  28.54 
 
 
381 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.38 
 
 
953 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  29.02 
 
 
366 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  24.95 
 
 
597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  30.58 
 
 
357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  27.3 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  28.44 
 
 
433 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  28.44 
 
 
434 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.49 
 
 
1018 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  28.51 
 
 
434 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  28.28 
 
 
434 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  27.96 
 
 
434 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  28.33 
 
 
434 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.34 
 
 
1012 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  31.18 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  31.36 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  28.05 
 
 
395 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  27.87 
 
 
818 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  33.06 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.05 
 
 
395 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.73 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  24.94 
 
 
603 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  26.9 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  27.18 
 
 
355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  23.11 
 
 
1007 aa  111  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  26.81 
 
 
374 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  26.59 
 
 
432 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  25 
 
 
338 aa  109  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  29.88 
 
 
343 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  24.15 
 
 
992 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  26.59 
 
 
432 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  26.59 
 
 
432 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  25.83 
 
 
438 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  26.59 
 
 
432 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.23 
 
 
480 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  26.37 
 
 
432 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  28.09 
 
 
334 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.51 
 
 
1002 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  28.64 
 
 
395 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  28.92 
 
 
433 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  30.77 
 
 
394 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.25 
 
 
447 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  27.67 
 
 
613 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  26.84 
 
 
375 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  24.86 
 
 
339 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  30.3 
 
 
409 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.26 
 
 
371 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  29.63 
 
 
347 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  24.46 
 
 
1003 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  35.78 
 
 
476 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  22.89 
 
 
336 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  37.44 
 
 
413 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  29.72 
 
 
344 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  34.88 
 
 
391 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  26.95 
 
 
454 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  21.95 
 
 
971 aa  99.8  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  34.95 
 
 
507 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  32.65 
 
 
483 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  25.61 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>