295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3420 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  79.09 
 
 
526 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  73.55 
 
 
530 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  73.55 
 
 
530 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  100 
 
 
526 aa  1037    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  73.55 
 
 
530 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  65.79 
 
 
534 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  57.79 
 
 
518 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  57.96 
 
 
552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  55.47 
 
 
541 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  56.95 
 
 
520 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  49.08 
 
 
546 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  48.41 
 
 
553 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  45.64 
 
 
551 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  44.59 
 
 
558 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  45.88 
 
 
548 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  45 
 
 
521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  44.22 
 
 
542 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  44.13 
 
 
539 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  42.16 
 
 
559 aa  343  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  42.88 
 
 
512 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  45.4 
 
 
498 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  49.16 
 
 
513 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  42.19 
 
 
563 aa  326  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  39.45 
 
 
541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  44.19 
 
 
547 aa  302  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  36.71 
 
 
522 aa  257  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.78 
 
 
540 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 
539 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.19 
 
 
520 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.25 
 
 
583 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.87 
 
 
530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.64 
 
 
556 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.84 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.19 
 
 
568 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.95 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.13 
 
 
543 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.61 
 
 
505 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.18 
 
 
546 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.29 
 
 
543 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.96 
 
 
562 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25.42 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.9 
 
 
565 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  28.82 
 
 
540 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.52 
 
 
527 aa  120  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  28.43 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  31.43 
 
 
565 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 
532 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.3 
 
 
544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.01 
 
 
556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  22.6 
 
 
533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  26.92 
 
 
549 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.01 
 
 
535 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.29 
 
 
543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  24.53 
 
 
548 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.18 
 
 
556 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.08 
 
 
522 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  22.06 
 
 
522 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.1 
 
 
543 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.73 
 
 
551 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  22.67 
 
 
522 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 
545 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  25.95 
 
 
541 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  28.54 
 
 
485 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.08 
 
 
537 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  22.67 
 
 
522 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  22.67 
 
 
522 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  29.83 
 
 
556 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.05 
 
 
569 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  22.47 
 
 
522 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.36 
 
 
538 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.63 
 
 
574 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  22.27 
 
 
522 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  22.27 
 
 
522 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.65 
 
 
544 aa  101  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.76 
 
 
538 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  30.9 
 
 
536 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  22.06 
 
 
522 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  26.74 
 
 
537 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.35 
 
 
550 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  29.81 
 
 
505 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26.29 
 
 
546 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.09 
 
 
522 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.1 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  22.44 
 
 
539 aa  97.8  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  22.06 
 
 
520 aa  98.2  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  24.69 
 
 
553 aa  97.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  27.49 
 
 
499 aa  97.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  21.5 
 
 
540 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  26.53 
 
 
542 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  26.79 
 
 
547 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11990  hypothetical protein  37.18 
 
 
361 aa  95.1  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.340317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  24.14 
 
 
522 aa  94.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  46.15 
 
 
266 aa  94.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  29.42 
 
 
536 aa  94.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  23.78 
 
 
552 aa  94  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.06 
 
 
545 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.52 
 
 
549 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  26.56 
 
 
542 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  25 
 
 
619 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>