More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1339 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 662 aa  1361    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.7 
 
 		 677 aa  580  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.13 
 
 		 879 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.26 
 
 		 685 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 		 676 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.83 
 
 		 886 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.73 
 
 		 674 aa  565  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.96 
 
 		 674 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.43 
 
 		 676 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.43 
 
 		 674 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.14 
 
 		 674 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.53 
 
 		 901 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.98 
 
 		 676 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.71 
 
 		 917 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.14 
 
 		 686 aa  542  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  44.84 
 
 		 899 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.5 
 
 		 687 aa  537  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  42.17 
 
 		 695 aa  530  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  42.98 
 
 		 745 aa  529  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.92 
 
 		 900 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.96 
 
 		 668 aa  529  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.36 
 
 		 898 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  41.9 
 
 		 687 aa  527  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.39 
 
 		 920 aa  528  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.93 
 
 		 904 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.17 
 
 		 689 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.56 
 
 		 893 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.97 
 
 		 688 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.02 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.08 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.15 
 
 		 893 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.88 
 
 		 906 aa  507  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 		 689 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.62 
 
 		 900 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.97 
 
 		 893 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.67 
 
 		 1440 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.7 
 
 		 686 aa  498  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.38 
 
 		 718 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 1440 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.47 
 
 		 925 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 721 aa  490  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41 
 
 		 1385 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 		 911 aa  488  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.6 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.52 
 
 		 903 aa  480  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.38 
 
 		 1410 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.17 
 
 		 1421 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.86 
 
 		 1426 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.68 
 
 		 937 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.64 
 
 		 1406 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.78 
 
 		 905 aa  475  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 961 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.94 
 
 		 963 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.31 
 
 		 1425 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.31 
 
 		 1425 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 		 1428 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.87 
 
 		 687 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.08 
 
 		 945 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.61 
 
 		 1425 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.32 
 
 		 927 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  40.71 
 
 		 1387 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.73 
 
 		 1424 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.09 
 
 		 723 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.62 
 
 		 716 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.64 
 
 		 754 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.95 
 
 		 963 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.77 
 
 		 724 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.31 
 
 		 1432 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.17 
 
 		 1432 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.59 
 
 		 988 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.59 
 
 		 988 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 		 1432 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.68 
 
 		 988 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  45.01 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.32 
 
 		 715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.32 
 
 		 715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.32 
 
 		 715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  37.17 
 
 		 715 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.17 
 
 		 715 aa  452  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  39.76 
 
 		 1412 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  37.89 
 
 		 715 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  37.17 
 
 		 715 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.03 
 
 		 715 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.16 
 
 		 989 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.16 
 
 		 989 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.16 
 
 		 989 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.43 
 
 		 716 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.92 
 
 		 989 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 		 942 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 		 957 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  37.89 
 
 		 715 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.63 
 
 		 949 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.62 
 
 		 888 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.03 
 
 		 716 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  37.19 
 
 		 713 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 		 987 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.13 
 
 		 716 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 		 766 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.62 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>