More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3322 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  785    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  62.09 
 
 		 395 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  61.96 
 
 		 868 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  56.6 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  56.71 
 
 		 390 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  55.34 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  55.07 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  54.55 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  48.33 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  40.32 
 
 		 379 aa  285  9e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  39.46 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.63 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  38.36 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  37.57 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 397 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  36.93 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  37.2 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  35.2 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  37.03 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.19 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 		 392 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  36.93 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 397 aa  239  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  39.85 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  39.34 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  34.84 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  35.64 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  39.51 
 
 		 418 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  34.99 
 
 		 413 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.07 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  36.89 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  36.89 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  35.11 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  39.21 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.54 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 390 aa  232  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  34.31 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  38.71 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  36.81 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  39.79 
 
 		 401 aa  232  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  35.98 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  36.81 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  33.24 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.42 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  36 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  37.4 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  38.1 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  33.24 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  36.81 
 
 		 393 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  35.2 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.53 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  36.55 
 
 		 392 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  34.43 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  34.93 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  37.47 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  34.07 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  35.96 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  34.67 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  36.55 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  35.73 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  36.55 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  36.99 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  36.27 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  34.67 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.22 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.22 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  36.29 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  37.57 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  34.13 
 
 		 398 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  38.42 
 
 		 398 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.93 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  36.46 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  36.44 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  33.42 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.42 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  38.65 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  35.56 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  35.51 
 
 		 377 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.89 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.38 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.38 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  34.4 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.59 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  37.94 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  38.15 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  34.13 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  34.13 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.31 
 
 		 401 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.79 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  34.45 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  32.34 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  35.52 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  35.92 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>