79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0175 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  64.44 
 
 		 134 aa  190  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  47.93 
 
 		 207 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  43.51 
 
 		 213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  44.27 
 
 		 231 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  41.13 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  39.5 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  38.33 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35.82 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  36.57 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  37.96 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  38.35 
 
 		 203 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  39.32 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  37.96 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  38.21 
 
 		 204 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  36.8 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  39.66 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  35.92 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  37.88 
 
 		 228 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  36.88 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  38.52 
 
 		 228 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  39.52 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  38.24 
 
 		 202 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  40.15 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  36.52 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  36.62 
 
 		 178 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  37.9 
 
 		 230 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  36.89 
 
 		 204 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  34.53 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  39.5 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  39.5 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  39.5 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  33.58 
 
 		 283 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  38.6 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  34.4 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  37.93 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.14 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  38.02 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  33.04 
 
 		 300 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  34.53 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  30.7 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  35.37 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  35.9 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  30.83 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  33.93 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  33.62 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  34.48 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  30.33 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  33.61 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.5 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  31.97 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  30.91 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  32.08 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  30.16 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  28.78 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  27.91 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  31.88 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  22.76 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  25.86 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  26.89 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  27.08 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  28.91 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  27.87 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  29.45 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  26.24 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  26.24 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.78 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  31.43 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  31.33 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 161 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>