More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1750 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.7 
 
 		 933 aa  1069    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 931 aa  1898    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  30.12 
 
 		 898 aa  348  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  28.81 
 
 		 939 aa  347  7e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 932 aa  332  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 909 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 928 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.24 
 
 		 927 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  28.31 
 
 		 943 aa  324  5e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.27 
 
 		 928 aa  317  8e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 		 937 aa  311  4e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  29.06 
 
 		 955 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 903 aa  310  8e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.27 
 
 		 897 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.3 
 
 		 944 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  26.95 
 
 		 954 aa  309  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  26.4 
 
 		 946 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  29.66 
 
 		 903 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 926 aa  305  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.17 
 
 		 972 aa  303  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.76 
 
 		 970 aa  293  8e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.89 
 
 		 916 aa  288  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.23 
 
 		 915 aa  279  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.07 
 
 		 701 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.39 
 
 		 913 aa  273  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.44 
 
 		 912 aa  271  4e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.06 
 
 		 916 aa  271  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  29.48 
 
 		 888 aa  268  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 905 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 854 aa  262  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.76 
 
 		 946 aa  257  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  29.7 
 
 		 925 aa  253  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  30.55 
 
 		 925 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.06 
 
 		 913 aa  248  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.79 
 
 		 1688 aa  248  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 		 890 aa  248  6e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.91 
 
 		 706 aa  243  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  29.26 
 
 		 875 aa  238  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.4 
 
 		 874 aa  237  7e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.01 
 
 		 1412 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  28.22 
 
 		 1434 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.95 
 
 		 874 aa  234  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 1429 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 698 aa  234  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.16 
 
 		 874 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.1 
 
 		 1426 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.9 
 
 		 1480 aa  231  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.83 
 
 		 872 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.67 
 
 		 1517 aa  229  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.09 
 
 		 873 aa  228  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  30.43 
 
 		 1495 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  27.59 
 
 		 870 aa  229  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1514 aa  227  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.6 
 
 		 1523 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 1451 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.06 
 
 		 1476 aa  224  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  26.64 
 
 		 1523 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.64 
 
 		 1523 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  28.05 
 
 		 1584 aa  223  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  31.08 
 
 		 1573 aa  222  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  27.31 
 
 		 710 aa  222  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.34 
 
 		 1505 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  30.03 
 
 		 1448 aa  221  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.52 
 
 		 736 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  30.64 
 
 		 1448 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  30.8 
 
 		 1388 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.88 
 
 		 1518 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  26.35 
 
 		 1544 aa  219  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.28 
 
 		 1510 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 1508 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.61 
 
 		 694 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  30.38 
 
 		 1515 aa  218  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.97 
 
 		 743 aa  218  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1480 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  26.07 
 
 		 1618 aa  217  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 744 aa  217  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.23 
 
 		 711 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  28.13 
 
 		 872 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.75 
 
 		 922 aa  215  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  26.64 
 
 		 1431 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  25.96 
 
 		 1538 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.4 
 
 		 1538 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  26.08 
 
 		 1538 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  26.08 
 
 		 1538 aa  213  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1538 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.08 
 
 		 1538 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.58 
 
 		 1497 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.89 
 
 		 716 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.48 
 
 		 708 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 675 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  30.69 
 
 		 1504 aa  212  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.09 
 
 		 1525 aa  212  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.08 
 
 		 1538 aa  211  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 710 aa  211  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  29.47 
 
 		 1534 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.61 
 
 		 1435 aa  210  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  28.33 
 
 		 740 aa  209  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.08 
 
 		 696 aa  208  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  31.26 
 
 		 1419 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  26.94 
 
 		 1535 aa  209  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>