63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1831 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  46.2 
 
 		 1201 aa  830    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  51.34 
 
 		 1118 aa  834    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  44.23 
 
 		 1186 aa  785    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  50.17 
 
 		 1164 aa  798    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  50.06 
 
 		 1173 aa  801    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  44.03 
 
 		 1128 aa  777    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  48.19 
 
 		 1172 aa  805    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  51.57 
 
 		 1118 aa  840    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  61.53 
 
 		 1231 aa  1136    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  60.57 
 
 		 1229 aa  1124    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  45.96 
 
 		 1153 aa  851    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  46.96 
 
 		 1167 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  44.86 
 
 		 1177 aa  810    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  100 
 
 		 1253 aa  2552    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  50.37 
 
 		 1193 aa  850    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  46.39 
 
 		 1101 aa  805    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  45.28 
 
 		 1165 aa  777    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  49 
 
 		 1144 aa  786    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  46.84 
 
 		 1181 aa  840    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  65.03 
 
 		 1214 aa  1490    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  54.02 
 
 		 1202 aa  986    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  25.22 
 
 		 485 aa  154  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  27.83 
 
 		 493 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 480 aa  147  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  25.8 
 
 		 492 aa  140  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  25.51 
 
 		 481 aa  137  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  25.4 
 
 		 505 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 		 482 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  23.85 
 
 		 493 aa  125  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  22.86 
 
 		 493 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  24.08 
 
 		 481 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  22.86 
 
 		 493 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  24.28 
 
 		 513 aa  119  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  23.34 
 
 		 480 aa  117  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 497 aa  98.2  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 		 459 aa  87.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2694  hypothetical protein  59.68 
 
 		 249 aa  70.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225762  hitchhiker  0.000408142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  44.57 
 
 		 208 aa  69.7  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2510  hypothetical protein  56.06 
 
 		 251 aa  67  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 		 467 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  41.56 
 
 		 224 aa  55.5  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  19.52 
 
 		 478 aa  54.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2789  hypothetical protein  39.47 
 
 		 184 aa  52.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  26.32 
 
 		 460 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  31.68 
 
 		 426 aa  50.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 426 aa  49.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  38.89 
 
 		 388 aa  49.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4096  hypothetical protein  40.85 
 
 		 164 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3551  normal  0.141036 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  37.78 
 
 		 388 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  52.17 
 
 		 437 aa  48.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  39.06 
 
 		 198 aa  47.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  42.25 
 
 		 214 aa  47.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  32.29 
 
 		 434 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  26.8 
 
 		 665 aa  47  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 565 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  30.48 
 
 		 786 aa  46.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  33.33 
 
 		 927 aa  45.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  31.82 
 
 		 385 aa  45.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  47.54 
 
 		 879 aa  45.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  31.45 
 
 		 926 aa  45.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1634  hypothetical protein  24.66 
 
 		 701 aa  45.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.26 
 
 		 422 aa  45.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>