16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2510 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2510  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2694  hypothetical protein  51.13 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225762  hitchhiker  0.000408142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  56.06 
 
 		 1253 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  35.24 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  38.81 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  39.13 
 
 		 402 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  38.67 
 
 		 388 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  38.67 
 
 		 388 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5200  hypothetical protein  40.68 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.540164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  32.58 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  30.34 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1732  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  26.52 
 
 		 226 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  36.36 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2789  hypothetical protein  35.59 
 
 		 184 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  31.75 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>