More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0208 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  65.58 
 
 
737 aa  885    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
734 aa  1440    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  53.09 
 
 
745 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.86 
 
 
758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.22 
 
 
741 aa  296  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  33.02 
 
 
766 aa  293  8e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  33.79 
 
 
796 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  30.8 
 
 
729 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.99 
 
 
733 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.48 
 
 
738 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.81 
 
 
729 aa  288  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  30.07 
 
 
730 aa  286  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.56 
 
 
743 aa  286  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.77 
 
 
1308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  32.7 
 
 
710 aa  284  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.69 
 
 
730 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  33.03 
 
 
773 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.93 
 
 
730 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
1155 aa  283  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.09 
 
 
740 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  33.29 
 
 
738 aa  280  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.41 
 
 
735 aa  280  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.88 
 
 
730 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.85 
 
 
730 aa  278  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.85 
 
 
730 aa  278  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.85 
 
 
730 aa  278  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  29.72 
 
 
730 aa  276  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.47 
 
 
743 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  29.61 
 
 
730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.47 
 
 
983 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.47 
 
 
983 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  29.72 
 
 
730 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.96 
 
 
717 aa  274  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.82 
 
 
979 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.12 
 
 
966 aa  271  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  31.41 
 
 
751 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 
758 aa  268  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.68 
 
 
735 aa  268  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  31.99 
 
 
805 aa  266  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  32.62 
 
 
731 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.89 
 
 
740 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.57 
 
 
842 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.18 
 
 
704 aa  263  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.08 
 
 
724 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  30.95 
 
 
769 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  30.95 
 
 
769 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  30.5 
 
 
770 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.88 
 
 
758 aa  260  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  32.18 
 
 
741 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.78 
 
 
968 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.78 
 
 
978 aa  259  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.38 
 
 
732 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 
752 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  31.23 
 
 
738 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  32.85 
 
 
783 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  32.97 
 
 
754 aa  254  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  32.97 
 
 
748 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.73 
 
 
740 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.39 
 
 
717 aa  251  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.87 
 
 
757 aa  251  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.51 
 
 
727 aa  250  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  32.36 
 
 
736 aa  250  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 
829 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 
829 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  28.34 
 
 
737 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.46 
 
 
997 aa  248  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.5 
 
 
750 aa  247  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.95 
 
 
743 aa  247  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  34.74 
 
 
741 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34.81 
 
 
743 aa  246  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.15 
 
 
718 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  31.51 
 
 
761 aa  243  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.03 
 
 
723 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  30.72 
 
 
731 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.89 
 
 
761 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  31.17 
 
 
737 aa  234  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.87 
 
 
1095 aa  234  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.04 
 
 
731 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  30.04 
 
 
839 aa  232  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  32.76 
 
 
767 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  32.76 
 
 
767 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  33.39 
 
 
767 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.34 
 
 
726 aa  230  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.61 
 
 
1013 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  30.85 
 
 
743 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  31.92 
 
 
953 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  31.89 
 
 
781 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.65 
 
 
796 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  28.69 
 
 
909 aa  227  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  30.28 
 
 
944 aa  226  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.56 
 
 
751 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  29.24 
 
 
728 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  31.97 
 
 
734 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.05 
 
 
724 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  33.19 
 
 
814 aa  226  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.78 
 
 
832 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  27.73 
 
 
760 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  31.83 
 
 
723 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  31.82 
 
 
751 aa  224  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.51 
 
 
779 aa  223  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>