77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5490 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  416  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  71.17 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  69.94 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  70.59 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  72.6 
 
 		 230 aa  237  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  73.79 
 
 		 228 aa  236  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  55.05 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  50.27 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  50.57 
 
 		 178 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  59.86 
 
 		 165 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  58.5 
 
 		 169 aa  174  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  55.91 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  54.76 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  54.76 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  53.17 
 
 		 179 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  46.22 
 
 		 147 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  42.98 
 
 		 123 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  40.48 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  38.57 
 
 		 145 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  44 
 
 		 147 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  41.73 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.34 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  39.87 
 
 		 167 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  35.26 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  31.34 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  38.52 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  36.88 
 
 		 134 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  35.62 
 
 		 135 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  40.65 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  35.97 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.43 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  33.1 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  31.76 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  35.51 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  31.91 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  29.08 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  35.51 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  36.36 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.8 
 
 		 139 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  31.76 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.4 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  33.55 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  32.24 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  29.08 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  29.68 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  28.12 
 
 		 300 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.94 
 
 		 162 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  33.59 
 
 		 134 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  31.67 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  28.17 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  30.53 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  31.72 
 
 		 129 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  33.13 
 
 		 161 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  26.23 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  28.26 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  26.4 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  25.71 
 
 		 129 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  26.23 
 
 		 262 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  31.13 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  26.87 
 
 		 140 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.39 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  26.49 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  23.81 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  30.19 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  36.51 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  34.78 
 
 		 151 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  34.78 
 
 		 151 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>