More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2908 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  72.77 
 
 		 223 aa  291  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  72.77 
 
 		 223 aa  291  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  72.77 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  70.97 
 
 		 218 aa  254  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  55.07 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  54.63 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  53.14 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  54.55 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  50.7 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  49.28 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  46.15 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  43.37 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  44.56 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 238 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  43.52 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 216 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 244 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 234 aa  94.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 265 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>