191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1503 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1503  PAS domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3578  hypothetical protein  41.48 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6284  PAS domain-containing protein  38.15 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3696  hypothetical protein  39.41 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.87171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3387  hypothetical protein  38.95 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.483515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1761  PAS domain-containing protein  30.95 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0132  PAS domain-containing protein  33.53 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.272922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 1532 aa  71.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 767 aa  71.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5109  PAS fold-3 domain protein  26.8 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.924849 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1171 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5882  PAS domain-containing protein  33.69 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.683919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 883 aa  68.2  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 603 aa  67.8  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2325  PAS domain-containing protein  39.66 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 789 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 793 aa  65.1  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4390  PAS domain-containing protein  38.94 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000850983  normal  0.838012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1215 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 759 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1795  PAS fold-3 domain protein  26.97 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.591789  normal  0.0452866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1198  PAS fold-3 domain protein  28.02 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  32.74 
 
 		 691 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4253  PAS domain-containing protein  30.32 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486718  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 2693 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  35.07 
 
 		 956 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1982  PAS fold-3 domain protein  27.74 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282752  normal  0.0152652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3718  PAS domain-containing protein  32.35 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.243172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 582 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1808 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 845 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4878  PAS domain-containing protein  36.05 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1167 aa  57.8  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  30.97 
 
 		 691 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 938 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0529  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.58 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1432 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.03 
 
 		 958 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  33.91 
 
 		 1225 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 689 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1018  PAS domain-containing protein  33.62 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.011057  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1225 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 686 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 685 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4309  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.97 
 
 		 766 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1501 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 		 1330 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 675 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1086 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  29.31 
 
 		 338 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1116 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 384 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 943 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  25.32 
 
 		 847 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 1224 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1464  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  26.17 
 
 		 1139 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 500 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 977 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 3706 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 689 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1579  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.12 
 
 		 324 aa  51.2  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 		 998 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  32.46 
 
 		 957 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 823 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  27.15 
 
 		 685 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  28.37 
 
 		 956 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 1111 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 		 1251 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 674 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1122 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 850 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 568 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 681 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4859  PAS domain-containing protein  29.27 
 
 		 338 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 806 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1068 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 		 361 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 814 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 1654 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 817 aa  47.8  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5345  PAS fold-3 domain protein  29.27 
 
 		 338 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1092 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 922 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 830 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1344 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  30.28 
 
 		 1417 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 1676 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  34.11 
 
 		 1086 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 519 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 526 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 1478 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  28.45 
 
 		 2272 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 494 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1313  PAS sensor protein  32.76 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 674 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 586 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 		 930 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>