More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0357 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
429 aa  852    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  75.23 
 
 
428 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  75.93 
 
 
428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  66.59 
 
 
434 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  64.95 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  64.25 
 
 
431 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 
431 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  57.62 
 
 
432 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 
430 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  59.57 
 
 
436 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  59.33 
 
 
436 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  59.33 
 
 
436 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  56.19 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  51.06 
 
 
436 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  53.68 
 
 
435 aa  428  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  47.38 
 
 
427 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 
433 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  47.58 
 
 
430 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 
430 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 
427 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  43 
 
 
427 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 
434 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 
433 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
435 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 
433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 
433 aa  282  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  39.56 
 
 
427 aa  275  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  39.56 
 
 
427 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 
427 aa  272  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 
427 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  40.55 
 
 
428 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 
427 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  41.11 
 
 
428 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 
428 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  45.05 
 
 
427 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 
428 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
428 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
428 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  40.57 
 
 
432 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 
423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 
429 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 
423 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  36.93 
 
 
429 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 
428 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
428 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
435 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
431 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 
434 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  38.5 
 
 
427 aa  229  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
428 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 
434 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
432 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  33.49 
 
 
427 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  33.02 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
428 aa  199  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.39 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
428 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
428 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
440 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  37.62 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
428 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
428 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
427 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
428 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 
436 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
433 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
427 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
427 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
428 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
427 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
427 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
427 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
431 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  32.32 
 
 
428 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
453 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
428 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
425 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
428 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  33.57 
 
 
431 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  34.2 
 
 
428 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  34.2 
 
 
428 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.02 
 
 
430 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
429 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.02 
 
 
430 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
427 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.02 
 
 
430 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
432 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
430 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
433 aa  186  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>