More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3503 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  95.87 
 
 		 487 aa  882    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  70.86 
 
 		 493 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  95.65 
 
 		 500 aa  880    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 478 aa  949    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  71.27 
 
 		 494 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  69.96 
 
 		 524 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  45.57 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  47.03 
 
 		 516 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  44.51 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  45.64 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  44.71 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  42.05 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  44.95 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  43.82 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  45.1 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  43.65 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  41.32 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  41.1 
 
 		 493 aa  356  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  41.53 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  40.95 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  41.07 
 
 		 503 aa  340  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  40.7 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  42.03 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  40.83 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  37.96 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  35.94 
 
 		 471 aa  285  9e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 		 513 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.37 
 
 		 490 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 		 489 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  30.8 
 
 		 489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30.34 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.4 
 
 		 489 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.23 
 
 		 479 aa  153  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.33 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  28.8 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  33.23 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  25.98 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  28.81 
 
 		 479 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.01 
 
 		 264 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  36.1 
 
 		 278 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 427 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 		 289 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  35.45 
 
 		 279 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  35.45 
 
 		 279 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 		 282 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  33.66 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  32.7 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.93 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  38.83 
 
 		 259 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.87 
 
 		 278 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  37.84 
 
 		 286 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33.51 
 
 		 484 aa  96.7  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  34.71 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.61 
 
 		 502 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  36.02 
 
 		 280 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.17 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  33 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  34.45 
 
 		 270 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.8 
 
 		 529 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  33.03 
 
 		 478 aa  94  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  33.03 
 
 		 478 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  33.85 
 
 		 266 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  34.08 
 
 		 263 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 		 270 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33 
 
 		 392 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 		 307 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.88 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  34.73 
 
 		 293 aa  90.9  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  32.52 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  33.16 
 
 		 320 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 		 292 aa  90.5  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  33.16 
 
 		 292 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 		 554 aa  90.1  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  32.9 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  35.08 
 
 		 488 aa  90.1  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  30.69 
 
 		 480 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  36.17 
 
 		 247 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  35.59 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  37.56 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.59 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.59 
 
 		 560 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  35.59 
 
 		 589 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.59 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35.59 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  35.59 
 
 		 589 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 		 269 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.94 
 
 		 268 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 		 268 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 269 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 		 270 aa  88.2  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 269 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 269 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>