168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2075 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 411 aa  797    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  77.18 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  77.18 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  61.4 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  48.05 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  42.09 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  41.88 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  37.21 
 
 		 783 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.17 
 
 		 849 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.17 
 
 		 850 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.61 
 
 		 851 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.28 
 
 		 850 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  38.79 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  37.31 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  37.31 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  34 
 
 		 842 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  37.94 
 
 		 844 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.21 
 
 		 843 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  35.62 
 
 		 850 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  35.62 
 
 		 850 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.49 
 
 		 840 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.45 
 
 		 840 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.5 
 
 		 849 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.59 
 
 		 844 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  29.02 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.23 
 
 		 885 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  32.8 
 
 		 822 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.84 
 
 		 892 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  27.84 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  29.5 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.11 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  24.03 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.51 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  29.44 
 
 		 491 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  29.12 
 
 		 489 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.02 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  20.44 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27 
 
 		 512 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  26.93 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  24.57 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  22.73 
 
 		 372 aa  90.5  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  21.63 
 
 		 374 aa  90.1  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  24.69 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.46 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  23.4 
 
 		 381 aa  86.7  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  27.71 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.26 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  26.12 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.11 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  25.67 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  35.34 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.28 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  24.48 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  27.85 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  24.14 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.86 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  22.64 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  26.87 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  25.32 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  28.57 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.77 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  27.36 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  25.06 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  24.77 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  24.38 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  23.36 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  25.3 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  26.46 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  26.6 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  24.21 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  26.18 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  25.35 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.36 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  22.65 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  23.76 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3413  hypothetical protein  30.53 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  22.88 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  25.65 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  23 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.81 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  25.3 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  24.23 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  23.76 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  25.18 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  23.41 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.68 
 
 		 533 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  22.3 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  26.03 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.25 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  22.8 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.25 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  24.88 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1810  PepSY-associated TM helix family protein  22.74 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.3 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  26.73 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  30.32 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.22 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  25.86 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>