221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0472 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  85.36 
 
 		 403 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  85.36 
 
 		 401 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 399 aa  768    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  64.29 
 
 		 421 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  67.84 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  64.96 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  51.69 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 		 403 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  50.84 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  48.88 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  51.3 
 
 		 400 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  50 
 
 		 407 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  48.45 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  48.68 
 
 		 415 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  50.43 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  40.91 
 
 		 413 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  41.13 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  40.72 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  39.56 
 
 		 420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  36.56 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  39.35 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  35.61 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  33.15 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  34.01 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.9 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  32.1 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  31.9 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  31.9 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  31.52 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  29.6 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.4 
 
 		 676 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  25.91 
 
 		 627 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  31.33 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  23.89 
 
 		 643 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.63 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.68 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  36.64 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  23.49 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  23.47 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 625 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  21.3 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  23.23 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  30.36 
 
 		 631 aa  60.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1695  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 651 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  24.76 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  21.09 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  26.2 
 
 		 621 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.88 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 		 382 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.69 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  21.88 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  19.72 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  21.35 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  25.89 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  23.55 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  21.56 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  23.06 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  23.82 
 
 		 662 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  22.64 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.27 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  23.27 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 379 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>