285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0026 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 398 aa  763    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  83.91 
 
 		 404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  68.83 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  71.18 
 
 		 401 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  72.25 
 
 		 399 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  68.93 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  51.89 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  48.58 
 
 		 399 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  49.23 
 
 		 399 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  50.93 
 
 		 403 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  48.98 
 
 		 425 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  50.41 
 
 		 403 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  52.45 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  50.66 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  53.33 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  42.74 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  40.45 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  40.22 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  40.52 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  36.66 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  39.1 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  35.28 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.98 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  33.72 
 
 		 394 aa  156  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  33.43 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  33.43 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  31.7 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  32.61 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  33.71 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  28.7 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.36 
 
 		 676 aa  96.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  25.91 
 
 		 627 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  38.1 
 
 		 494 aa  79.7  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  31.11 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.74 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  22.67 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 643 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  32.53 
 
 		 631 aa  66.6  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  30.35 
 
 		 625 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.35 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.27 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  22.47 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  21.86 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  34.24 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.23 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0744  Extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.25 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 449 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  26 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.08 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.84 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  26.62 
 
 		 621 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  23.71 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  22.56 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.71 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.71 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.71 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.71 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  23.71 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  23.08 
 
 		 662 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  25.52 
 
 		 612 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  25.52 
 
 		 612 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  27.42 
 
 		 674 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 814 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  34.74 
 
 		 368 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 651 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>