176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0023 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 404 aa  773    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  84.16 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  65.58 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  67.82 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  68.39 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  62.16 
 
 		 421 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  52.86 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  52.38 
 
 		 403 aa  330  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  50.67 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  49.61 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  47.21 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  50.39 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  51.99 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  53.33 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  42.54 
 
 		 413 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  41.33 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  40.33 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  39.15 
 
 		 408 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  38.62 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  34.81 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.85 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  34.72 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  32.85 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  32.85 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  34.01 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  32.86 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  32.29 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  33.9 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  30.09 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.23 
 
 		 676 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  25.75 
 
 		 627 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  31.85 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3118  hypothetical protein  36.51 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.94 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  32.93 
 
 		 631 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 625 aa  63.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  36.09 
 
 		 628 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0744  Extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.7 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  27.74 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.94 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  21.13 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2167  hypothetical protein  27.12 
 
 		 674 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0901646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  22.93 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  23.34 
 
 		 612 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.17 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  23.34 
 
 		 612 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  33.68 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  34.29 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  24.19 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.55 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  21.94 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  21.01 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  21.99 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.14 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.53 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.86 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  21.76 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  23.83 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>