More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3599 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 791 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 777 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  49.33 
 
 		 791 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 810 aa  991    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  49.08 
 
 		 791 aa  749    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 844 aa  1703    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  59.15 
 
 		 485 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  61.63 
 
 		 491 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  57.91 
 
 		 483 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  62.68 
 
 		 479 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  62.44 
 
 		 479 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  62.2 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  62.23 
 
 		 481 aa  545  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  62.04 
 
 		 413 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  34.76 
 
 		 775 aa  277  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  36.36 
 
 		 345 aa  253  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  37.05 
 
 		 359 aa  246  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  39 
 
 		 389 aa  244  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  36.45 
 
 		 343 aa  242  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  37.15 
 
 		 358 aa  241  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  37.47 
 
 		 343 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 316 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  32.55 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 		 454 aa  157  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  29.37 
 
 		 324 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  31.36 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 		 320 aa  151  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.36 
 
 		 313 aa  147  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  32.68 
 
 		 318 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  31.11 
 
 		 443 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  30 
 
 		 347 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  31.95 
 
 		 321 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 416 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 416 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.94 
 
 		 321 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 416 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 320 aa  137  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  31.3 
 
 		 316 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  29.57 
 
 		 316 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  28.95 
 
 		 312 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 		 315 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  29.95 
 
 		 379 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 329 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  32.29 
 
 		 418 aa  129  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  31.22 
 
 		 381 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  29.95 
 
 		 438 aa  128  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29.71 
 
 		 438 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  28.99 
 
 		 315 aa  127  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  31.49 
 
 		 363 aa  124  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.6 
 
 		 322 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  31.41 
 
 		 412 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  26.56 
 
 		 439 aa  117  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.47 
 
 		 315 aa  117  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.74 
 
 		 324 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 347 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  29.63 
 
 		 328 aa  111  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 346 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 346 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 346 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  28.9 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 330 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.1 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 324 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  28.88 
 
 		 312 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 318 aa  104  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  26.91 
 
 		 318 aa  103  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  28.88 
 
 		 312 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  28.01 
 
 		 484 aa  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  36.36 
 
 		 314 aa  102  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 327 aa  101  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 324 aa  101  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 318 aa  100  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  29.4 
 
 		 319 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.8 
 
 		 319 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  34.34 
 
 		 314 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.8 
 
 		 319 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 368 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  27.96 
 
 		 305 aa  98.2  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 325 aa  98.2  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 318 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.75 
 
 		 360 aa  95.9  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 288 aa  95.5  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 318 aa  94.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  34.34 
 
 		 314 aa  94.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.73 
 
 		 342 aa  94.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 305 aa  93.6  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  31.98 
 
 		 313 aa  94  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 298 aa  92.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  27.18 
 
 		 318 aa  91.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  30.52 
 
 		 291 aa  92  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  30.21 
 
 		 393 aa  90.5  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 305 aa  90.5  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  27.67 
 
 		 332 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 317 aa  87.8  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  24.53 
 
 		 498 aa  87.8  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 319 aa  87.4  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 339 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.3 
 
 		 329 aa  86.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 319 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>