93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3331 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  60.64 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  56.06 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  53.73 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  53.73 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  53.73 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  53.73 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  53.73 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  53.73 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  48.48 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  53.73 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.1 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  42.65 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  43.55 
 
 		 476 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  45.31 
 
 		 410 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.33 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2262  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  43.4 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  43.4 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  43.4 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.4 
 
 		 199 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 199 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  48.89 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  27.27 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  36.21 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4308  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  67.74 
 
 		 378 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  27.27 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  27.27 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  27.27 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  27.27 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  44.19 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 513 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  47.73 
 
 		 481 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  44.19 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  37.1 
 
 		 88 aa  40  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4902  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 84 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173853  normal  0.0865423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  39.62 
 
 		 469 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 101 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>