73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7175 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  100 
 
 		 409 aa  804    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  73.37 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  59.89 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  58.51 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  59.83 
 
 		 437 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  46.6 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  43.22 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  42.26 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  42.53 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  41.3 
 
 		 396 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  42.52 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  39.73 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  42.27 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  41.99 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  43.11 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  42.54 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  41.06 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  41.06 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  41.39 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  40.05 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  40.92 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  45.07 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  37.35 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  43.21 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  39.17 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  35.73 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  37.31 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  38.46 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  47.95 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  47.95 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  47.95 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  38.75 
 
 		 438 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  38.46 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  30.1 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.95 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  31.79 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.11 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  34.29 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  34.29 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  32.76 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  30.85 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.29 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.48 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  29.07 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.95 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  26.5 
 
 		 252 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  25.93 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  28.02 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  25.1 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  26.78 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  27.08 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  29.27 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  30.27 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  27.78 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.66 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  24.9 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  33.33 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  28.31 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  32.2 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.8 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  25.13 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  24.5 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  26.32 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.8 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.6 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  29.28 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  25.13 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  26.32 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  29.52 
 
 		 495 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.22 
 
 		 251 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  28.57 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  28.8 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.23 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>