78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4974 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  85.38 
 
 		 199 aa  315  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  68.57 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  68.32 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  69.74 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  71.72 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  54.84 
 
 		 202 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  57.23 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  58.94 
 
 		 204 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  61.38 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  58.62 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  57.6 
 
 		 154 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  55.56 
 
 		 170 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  55.56 
 
 		 170 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  53.97 
 
 		 179 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  44.27 
 
 		 146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  45.97 
 
 		 123 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  39.46 
 
 		 145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  36.57 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  46.22 
 
 		 147 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  38.06 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  38.85 
 
 		 145 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  43.55 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  42.98 
 
 		 147 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  45.16 
 
 		 167 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  40.44 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  42.28 
 
 		 156 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  38.35 
 
 		 135 aa  94.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  38.69 
 
 		 134 aa  92  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  34.93 
 
 		 139 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  38.33 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  38.3 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  36.23 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  30.88 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  36.44 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  35.51 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  33.78 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  31.91 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  30.47 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  30.58 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  28.67 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  28.12 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  29.84 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  29.6 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  31.36 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  30.83 
 
 		 119 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.69 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  28.67 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  27.74 
 
 		 141 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  26.35 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  33.06 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  30.3 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  32.39 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  33.06 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  30.82 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  32 
 
 		 153 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  27.21 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  29.37 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  24.62 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  26.97 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  24.44 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  25.2 
 
 		 144 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  35.38 
 
 		 112 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>