More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2776 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2776  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 313 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1922  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  86.42 
 
 		 308 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2317  pyruvate carboxyltransferase  61.94 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  46.32 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  44.82 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  41.09 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  44.21 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.55 
 
 		 729 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  46.67 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  43.31 
 
 		 744 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  43.57 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  43.77 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  42.96 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  44.59 
 
 		 308 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  42.71 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  41.81 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2061  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.42 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4804  pyruvate carboxyltransferase  43.33 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  40.82 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.34 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  43.39 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6961  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.94 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  40.88 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  41.99 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  43.39 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6248  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.49 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.34 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  38.72 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2559  pyruvate carboxyltransferase  41.32 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.28 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1756  pyruvate carboxyltransferase  44.69 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  42.67 
 
 		 328 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  41.22 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.29 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.09 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3137  pyruvate carboxyltransferase  41.87 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676555  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  41.3 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  41.82 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  43.48 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.28 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2762  pyruvate carboxyltransferase  40.66 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.32 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  42.33 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  41.28 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  41.28 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  40.69 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  42.61 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3394  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase, putative  41.11 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.461441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.2 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  40.61 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.49 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  39.79 
 
 		 311 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00102  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.18 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  39.39 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  40.8 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  41.39 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  36.9 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  43.48 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  38.13 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.47 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  36.53 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.25 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  41.28 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  39.49 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  40.29 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.46 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.13 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.07 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.03 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  39.06 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0806  pyruvate carboxyltransferase  42.61 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6280  pyruvate carboxyltransferase  42.27 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  39.71 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5984  pyruvate carboxyltransferase  41.92 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2695  pyruvate carboxyltransferase  41.88 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  38.44 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.66 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.66 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.66 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  41.44 
 
 		 320 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  39.68 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.98 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.41 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.41 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.77 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  42.39 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.07 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.03 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.44 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  42.23 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.03 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  40.79 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  43.38 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.29 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6613  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 319 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  41.06 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  38.74 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>