294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3889 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  100 
 
 
248 aa  518  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  46.28 
 
 
243 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  44.08 
 
 
261 aa  241  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  44.9 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  44.21 
 
 
244 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  44.49 
 
 
244 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  44.49 
 
 
244 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  44.08 
 
 
244 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  44.08 
 
 
244 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  44.08 
 
 
244 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  43.8 
 
 
244 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  43.27 
 
 
244 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  45.12 
 
 
244 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  42.45 
 
 
244 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  41.9 
 
 
253 aa  225  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  46.09 
 
 
242 aa  208  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  40.82 
 
 
240 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  41.63 
 
 
257 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  39.59 
 
 
240 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  39.92 
 
 
240 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  39.92 
 
 
240 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  39.92 
 
 
240 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  39.59 
 
 
240 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  39.92 
 
 
240 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  39.59 
 
 
240 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  40 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  39.59 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  39.59 
 
 
240 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  36.9 
 
 
249 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  39.92 
 
 
240 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  41.74 
 
 
240 aa  184  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  40.82 
 
 
240 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  38.62 
 
 
240 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  38.62 
 
 
240 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  38.62 
 
 
240 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  38.62 
 
 
240 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  38.21 
 
 
240 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  37.96 
 
 
240 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  36.63 
 
 
251 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  40.08 
 
 
239 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  36.29 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  38.59 
 
 
273 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  39.68 
 
 
239 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  35.22 
 
 
250 aa  159  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  36.8 
 
 
273 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  33.47 
 
 
251 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  33.47 
 
 
251 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32.13 
 
 
251 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  36.57 
 
 
273 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  29.43 
 
 
269 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  31.3 
 
 
253 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  35.18 
 
 
288 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  36.55 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  32.1 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  39.2 
 
 
273 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  34.14 
 
 
286 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  33.05 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  32.1 
 
 
246 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  36.11 
 
 
276 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  32.1 
 
 
246 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  35.43 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  30.92 
 
 
246 aa  131  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  37.3 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  32.68 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  32.34 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  32.86 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  33.33 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  30.58 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  36.36 
 
 
274 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  33.73 
 
 
274 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  32.14 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  34.29 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  28.86 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  29.67 
 
 
245 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  28.19 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  27.82 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  27.76 
 
 
238 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  28.11 
 
 
248 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  30.37 
 
 
251 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  32.28 
 
 
238 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  34.91 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.87 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.78 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.02 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  31.69 
 
 
270 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.5 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.81 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.89 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.07 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.37 
 
 
174 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.65 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.81 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.38 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.08 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  24.86 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.88 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  27.72 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  27.12 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>