More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3069 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
441 aa  904    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  65.99 
 
 
439 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  66.07 
 
 
445 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  65.16 
 
 
442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  63.95 
 
 
441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  61.45 
 
 
441 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  63.04 
 
 
441 aa  541  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  58.73 
 
 
441 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  62.36 
 
 
441 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  61.45 
 
 
441 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  61.22 
 
 
441 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  60.77 
 
 
441 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  61 
 
 
441 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  61 
 
 
441 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  61 
 
 
441 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  61.45 
 
 
441 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  60.54 
 
 
466 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  55.33 
 
 
441 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  58.5 
 
 
441 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  46.42 
 
 
460 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 
441 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 
445 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  46.06 
 
 
443 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
442 aa  362  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
442 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 
443 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  38.89 
 
 
443 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  38.03 
 
 
447 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  36.77 
 
 
442 aa  294  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  37.79 
 
 
447 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
444 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 
446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 
451 aa  282  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
447 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
433 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
431 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  33.73 
 
 
446 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  35.41 
 
 
442 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  35.41 
 
 
442 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
442 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
442 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  35.41 
 
 
442 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
442 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  35.41 
 
 
442 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
446 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
431 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
430 aa  239  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 
444 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
444 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  34.21 
 
 
436 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
444 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
444 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
430 aa  236  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
444 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
455 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
423 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
428 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
471 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
396 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
390 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
388 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.87 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
382 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
389 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.75 
 
 
384 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 
391 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
376 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
394 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
401 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
816 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
385 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
386 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.96 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
388 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.96 
 
 
369 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
816 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  23.76 
 
 
390 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 
393 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.65 
 
 
369 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
492 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.65 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
373 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
385 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>