More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0214 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.49 
 
 
755 aa  731    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  44.4 
 
 
747 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.31 
 
 
757 aa  684    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.05 
 
 
758 aa  705    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  46.58 
 
 
762 aa  727    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.92 
 
 
750 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.34 
 
 
790 aa  666    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
800 aa  1662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  46.6 
 
 
755 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.99 
 
 
749 aa  720    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.52 
 
 
751 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.55 
 
 
813 aa  608  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  43.19 
 
 
777 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  46.87 
 
 
741 aa  608  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  46.25 
 
 
750 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  44.63 
 
 
809 aa  595  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  46.92 
 
 
749 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  42.53 
 
 
740 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.91 
 
 
742 aa  592  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  40.96 
 
 
737 aa  580  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  44.73 
 
 
757 aa  581  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.68 
 
 
758 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  41.13 
 
 
760 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  39.18 
 
 
874 aa  555  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.47 
 
 
748 aa  535  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.3 
 
 
737 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.9 
 
 
780 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  38.36 
 
 
738 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.72 
 
 
734 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  37.48 
 
 
716 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  37.95 
 
 
701 aa  434  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  36.87 
 
 
793 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.72 
 
 
721 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  36.87 
 
 
793 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35.36 
 
 
721 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.63 
 
 
722 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  37.07 
 
 
814 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  36.77 
 
 
708 aa  420  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.25 
 
 
745 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  35.54 
 
 
714 aa  404  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.08 
 
 
757 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 
711 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  34.88 
 
 
717 aa  405  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.31 
 
 
731 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.95 
 
 
987 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 
685 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  35.32 
 
 
691 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.09 
 
 
933 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.34 
 
 
746 aa  357  5.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  35.24 
 
 
748 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.18 
 
 
1072 aa  351  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  34.08 
 
 
733 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  34.08 
 
 
733 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  34.9 
 
 
693 aa  348  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  34.08 
 
 
733 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  32.34 
 
 
731 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  32.95 
 
 
737 aa  343  8e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  33.05 
 
 
733 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.48 
 
 
1158 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.96 
 
 
497 aa  342  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  33.76 
 
 
733 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.51 
 
 
724 aa  341  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  33.29 
 
 
730 aa  340  7e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  32.77 
 
 
733 aa  340  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  32.34 
 
 
922 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  33.15 
 
 
748 aa  339  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  32.2 
 
 
731 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  33.38 
 
 
733 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.82 
 
 
1321 aa  334  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.06 
 
 
756 aa  334  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  32.35 
 
 
731 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  32.38 
 
 
1338 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  33.53 
 
 
779 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  44.68 
 
 
914 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
751 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
751 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
751 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  32.42 
 
 
748 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 
777 aa  306  7e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.1 
 
 
829 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.78 
 
 
772 aa  302  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.98 
 
 
778 aa  302  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.98 
 
 
778 aa  300  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  44.02 
 
 
823 aa  300  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  29.79 
 
 
727 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  43.3 
 
 
915 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  30.35 
 
 
822 aa  298  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  30.94 
 
 
735 aa  295  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.23 
 
 
762 aa  293  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.15 
 
 
737 aa  292  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.34 
 
 
820 aa  290  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.43 
 
 
771 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  30.41 
 
 
772 aa  287  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.15 
 
 
790 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  31.48 
 
 
931 aa  280  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.47 
 
 
814 aa  280  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  38.25 
 
 
836 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.27 
 
 
760 aa  278  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 
805 aa  277  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.57 
 
 
783 aa  276  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>