90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1176 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  850    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  27.88 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  29.59 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  28.57 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  29.86 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  31.39 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  24.24 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  27.92 
 
 		 427 aa  92.8  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  28.23 
 
 		 339 aa  92.8  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  24.82 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  24.23 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  25.64 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  26.33 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  32.08 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  19.88 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  23.37 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  31.49 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  22.77 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.78 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  23.53 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  21.53 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  22.11 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  21.68 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.57 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  24.37 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  22.76 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.78 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  21.75 
 
 		 1241 aa  56.6  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.78 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  21.92 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  23.81 
 
 		 349 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  22.15 
 
 		 1208 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  25.32 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  22.27 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  33.98 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5868  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.24 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  20.89 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  21.43 
 
 		 1144 aa  50.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  21.82 
 
 		 1243 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  22.8 
 
 		 1201 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  29.11 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3257  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.69 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.21701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  20.82 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  21.15 
 
 		 1206 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  25.36 
 
 		 1212 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3756  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.79 
 
 		 682 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0388867  normal  0.0417354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4717  pyruvate carboxylase  22.4 
 
 		 1169 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  21.61 
 
 		 1200 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30519  precursor of carboxylase pyruvate carboxylase  29.35 
 
 		 1252 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0025  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  24.41 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3483  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  20.37 
 
 		 662 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0138  pyruvate carboxylase subunit A  19.67 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.732252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  21.88 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  21.7 
 
 		 1169 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  22.75 
 
 		 1176 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0119  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  23.31 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.334605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  19.45 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  23.7 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2437  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  24.29 
 
 		 1164 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  21.67 
 
 		 1173 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  24.88 
 
 		 1209 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10656  conserved hypothetical protein  21.02 
 
 		 795 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.426942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  20.12 
 
 		 670 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  22.77 
 
 		 1172 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  21.61 
 
 		 1201 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  21.23 
 
 		 1179 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  23.7 
 
 		 1179 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  26.61 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.19 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  20.85 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1375  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  19.71 
 
 		 485 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0154864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  21.46 
 
 		 1226 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  19.81 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  22.44 
 
 		 1203 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3760  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  23.44 
 
 		 662 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  20 
 
 		 1231 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.67 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0548  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  21.76 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1017  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  20.19 
 
 		 675 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.848501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  24.2 
 
 		 1205 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4003  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  20.83 
 
 		 667 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.666441  normal  0.37304 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  29.81 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2802  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.22 
 
 		 684 aa  43.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  24.52 
 
 		 1233 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  22.64 
 
 		 1209 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  24.84 
 
 		 1238 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  21.7 
 
 		 1179 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5266  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  22.01 
 
 		 677 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  25 
 
 		 1204 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>