85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0371 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  377  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  48.35 
 
 
197 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  46.07 
 
 
192 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  44.92 
 
 
192 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  43.81 
 
 
194 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  43.96 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  43.09 
 
 
193 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  44.09 
 
 
192 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  43.41 
 
 
193 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  41.58 
 
 
205 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  41.58 
 
 
193 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  41.58 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  40.84 
 
 
214 aa  150  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  41.05 
 
 
193 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  47.57 
 
 
191 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  46.93 
 
 
193 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  45.61 
 
 
187 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  41.67 
 
 
198 aa  148  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  49.4 
 
 
193 aa  147  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  47.78 
 
 
193 aa  147  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.09 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  40.88 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  42.86 
 
 
193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  41.67 
 
 
193 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  41.8 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  41.8 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  39.46 
 
 
195 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  41.54 
 
 
198 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  41.27 
 
 
193 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  41.53 
 
 
212 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  42.69 
 
 
193 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  41.24 
 
 
196 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  41.52 
 
 
193 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  42.61 
 
 
198 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40.11 
 
 
196 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  40.41 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  42.41 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  37.63 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  42.35 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  41.48 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  40.41 
 
 
196 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  40.41 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  46.47 
 
 
194 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  42.69 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  46.11 
 
 
195 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  36.36 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  41.21 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.41 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  34.29 
 
 
416 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  32.2 
 
 
204 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  33.92 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  32.47 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  24.38 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  36.09 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  35.34 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  24.85 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  35.34 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  35.34 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  31.09 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  30.57 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  32.89 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  27.81 
 
 
192 aa  57.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.88 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  35.25 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  28.02 
 
 
198 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  25.97 
 
 
202 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  29.55 
 
 
210 aa  48.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  27.07 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  28.12 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  25.58 
 
 
157 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.49 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  25.38 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  24.64 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  25.95 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  27.4 
 
 
143 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  31.16 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.21 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  24.81 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  23.21 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  24.36 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.79 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.71 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.23 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  25.66 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  30.15 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>