More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0436 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  100 
 
 		 323 aa  658    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  56.19 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  57.93 
 
 		 322 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  56.73 
 
 		 322 aa  358  6e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  52.98 
 
 		 322 aa  351  7e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  52.74 
 
 		 328 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  51.6 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  49.23 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  48.47 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  48.47 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  47.95 
 
 		 324 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  47.63 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  48.44 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  43.56 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  44.05 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  36.53 
 
 		 398 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  36.27 
 
 		 347 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  34.97 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  32.51 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  24.24 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  23.91 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  24.41 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  24.41 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  25.82 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  24.41 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  24.56 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.69 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  24.6 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  27 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.06 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  24.74 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  23.43 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0713  phage integrase  22.74 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  22.82 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  30.1 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.37 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  26.89 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  31.03 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  29.89 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  31.82 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.95 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  29.35 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.5 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  22.76 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.96 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.41 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  24.28 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  24.81 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  24.81 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  24.81 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1536  phage integrase  29.78 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  24.81 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  24.81 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  24.81 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  24.58 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  25.35 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.86 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  22.56 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  25.58 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  25.08 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  27.18 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.19 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  25.91 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.46 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  23.62 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  25.38 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  25.64 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.66 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  31.87 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  34.38 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  34.15 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  26.71 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  26.06 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  26.71 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.78 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  32.73 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>