More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0153 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  91.24 
 
 		 447 aa  777    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  100 
 
 		 447 aa  868    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  92.58 
 
 		 452 aa  788    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  62.22 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  43.67 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  41.5 
 
 		 452 aa  338  8e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  34.32 
 
 		 451 aa  272  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  33.79 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  33.71 
 
 		 467 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  31.84 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  33.79 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 477 aa  246  9e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  32.27 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 454 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  31.25 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  32.67 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  33.02 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 455 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  32.37 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  32.54 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  32.61 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  32.06 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  32.06 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  32.86 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.37 
 
 		 451 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  33.83 
 
 		 446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 449 aa  226  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  31.18 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  31.32 
 
 		 449 aa  220  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  32.37 
 
 		 449 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  31.61 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  31.07 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  33.02 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  31.13 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  30.09 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 460 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  33.94 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 461 aa  206  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  31.19 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  30.77 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  30.77 
 
 		 451 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  32.23 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.86 
 
 		 451 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.68 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 456 aa  182  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  28.63 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.86 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 451 aa  179  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.77 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.84 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.84 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.93 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 466 aa  166  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  25.91 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  27.69 
 
 		 456 aa  166  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  31.93 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 461 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  26.98 
 
 		 435 aa  159  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.91 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  26.14 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.31 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  28.17 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  26.24 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.82 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  27.59 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.04 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 452 aa  146  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>