86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2661 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  100 
 
 
437 aa  871    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  44.68 
 
 
440 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  44.69 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  28.2 
 
 
441 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
433 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  23.62 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.14 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.13 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  28.74 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.5 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.5 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  19.16 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  20.94 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  27.27 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  27.14 
 
 
444 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  27.14 
 
 
445 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  22.33 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  21.47 
 
 
402 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  23.76 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  26.63 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  27.03 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
412 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  20.51 
 
 
406 aa  50.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25.37 
 
 
474 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  25.87 
 
 
442 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  27.18 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  27.39 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  25.5 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  25.5 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  23.51 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  25.5 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  25.5 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.62 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  25.5 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  25.5 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  21.81 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  24.57 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  25.63 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  28.29 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  26.7 
 
 
474 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  26.76 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  23.32 
 
 
427 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
425 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  26.09 
 
 
495 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  26.54 
 
 
491 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.98 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.46 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  21.75 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
503 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.38 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  30.66 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  23.55 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  26.04 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  24.49 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.81 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
406 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  23.5 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  28.09 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  26.38 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  29.27 
 
 
403 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  34.29 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  24.75 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
423 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  25.64 
 
 
398 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 
417 aa  43.1  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>